La capilla de los Capuchinos encierra siglos de historia; en el año 1626 el barón Paul Emmanuel di Challant con un acto fechado el 22 de marzo, cedió una casa al orden a fin de fundar un convento. En 1633, después de los trabajos de ajuste, los primeros frailes capuchinos se establecieron allí.
Una capilla dedicada a San Grato, el poderoso taumaturgo invocado contra enfermedades, guerras y hambrunas, se anexó a la casa que luego fue transformada en convento. Juzgada demasiado pequeña, la capilla fue completamente reconstruida entre 1635 y 1642 y dedicada a San Francisco de Asís, refigurado en un hermoso altar de madera que todavía se puede admirar hoy, junto con los escudos de las familias Challant y Passerin d’Entrèves.

La Revolución francesa condujo a la supresión de muchas instituciones monásticas y en 1802, después de los conventos de Aosta y Morgex, fue también la época de Châtillon: los frailes fueron expulsados y el edificio utilizado como almacén para las tropas.

Después de varias vicisitudes y cambios de usos, en 1895 el obispo de Aosta, Mons. Joseph Joseph Duc, compró el edificio a la Municipalidad y el convento alberga actualmente la única comunidad capuchina presente en el Valle de Aosta.